Búsqueda de Datos primarios de Biodiversidad

Antonio J. Pérez-Luque
antonio.perez@inia.csic.es

Instituto de Ciencias Forestales (CIFOR) | INIA-CSIC (Madrid)

2025-03-06

¿Dónde buscar datos de Biodiversidad?

Portal de datos de GBIF

  • Ir al portal de datos de http://datos.gbif.es

  • Realiza una búsqueda por el nombre de un taxon, e.g. Quercus pyrenaica, en la barra de búsqueda y clica en el botón de búsqueda

Resultados

Important

Los resultados de la búsqueda se filtran ahora por defecto para excluir los registros de menor calidad de acuerdo con el perfil de datos General de GBIF.ES

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API (Application Programming Interface)

Howie Mann

Uso de APIs en GBIF

I Mini Taller portal de GBIF Internacional (05/03/2014)

GBIF API. Ejemplo

https://api.gbif.org/v1/species/match?name=Quercus pyrenaica

  • URL base: https://api.gbif.org/v1
  • Grupo/Namespace que queremos consultar: species, occurrences, etc. Mas información en documentación de Referencia
  • Función: funcionalidad a usar: buscar (search), coincidencia (match), etc.
  • Parámetro: los parámetros para nuestra llamada: e.g. name.
  • consulta: la consulta dentro de dicho parámetro

Documentación Oficial

Resultado: Archivo JSON

{
  "usageKey": 2878826,
  "scientificName": "Quercus pyrenaica Willd.",
  "canonicalName": "Quercus pyrenaica",
  "rank": "SPECIES",
  "status": "ACCEPTED",
  "confidence": 97,
  "matchType": "EXACT",
  "kingdom": "Plantae",
  "phylum": "Tracheophyta",
  "order": "Fagales",
  "family": "Fagaceae",
  "genus": "Quercus",
  "species": "Quercus pyrenaica",
  "kingdomKey": 6,
  "phylumKey": 7707728,
  "classKey": 220,
  "orderKey": 1354,
  "familyKey": 4689,
  "genusKey": 2877951,
  "speciesKey": 2878826,
  "synonym": false,
  "class": "Magnoliopsida"
}

Exportación de nuestra búsqueda

https://registros-ws.gbif.es/occurrences/search?q=lsid%3A2878826&qualityProfile=LA

Exportación de nuestra búsqueda

https://registros-ws.gbif.es/occurrences/search?q=lsid%3A2878826&qualityProfile=LA

Tipos de búsquedas:

  • Simple

  • Avanzada

  • Por nombres científicos (lotes)

  • Por números de catálogo

  • Eventos

  • Espacial (Área)

Búsqueda Espacial

Tipos de búsquedas espaciales

  • Dibujar un área de interés

  • Importar un área:

  • Regiones definidas

Dibujar un área de interés

Dibujar un área de interés (resultados)

WKT

  • Definir area usando un archivo WKT

Regiones Definidas

Regiones Definidas

  • Seleccionar Región Definida

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Ayuda JDC2022-050056-I financiada por MCIN/AEI /10.13039/501100011033 y por la Unión Europea NextGenerationEU/PRTR

Si usas esta presentación puedes citarla como:

Pérez-Luque, A.J. (2025). Búsqueda de Datos primarios de Biodiversidad. Material Docente de la Asignatura: Ciclo de Gestión de los Datos. Master Universitario en Conservación, Gestión y Restauración de la Biodiversidad. Universidad de Granada. https://ecoinfugr.github.io/ecoinformatica/